Ο Θεμιστοκλής Παπαθεοφάνους γεννήθηκε το 1949 στα Κουμέικα. Γονείς του ο Δημήτριος και η Ευαγγελία Παπαθεοφάνους. Μόνιμος κάτοικος της γενέτειράς του, είναι παντρεμένος με τη Σταυρούλα Καλμούκου και έχει ένα γιό τον Δημήτρη και δυο εγγόνια τον Θεμιστοκλή και τον Άγγελο. Κατέχει άδεια Λογιστή – Φοροτέχνη Α’ Τάξης από το Οικονομικό Επιμελητήριο της Ελλάδος.
Από το 1983 μέχρι σήμερα είναι Πρόεδρος στον Πολιτιστικό Σύλλογο Κουμεΐκων.
Από το 1990 μέχρι τo 1992 ήταν Πρόεδρος στον Σύλλογο Λογιστών της Σάμου.
Από το 1993 μέχρι το 2001 και από το 2006 μέχρι το 2009 ήταν Πρόεδρος στο Επιμελητήριο της Σάμου, στο οποίο υπήρξε και Α’ Αντιπρόεδρος από το 2009 μέχρι το 2011.
Από το 2009 μέχρι το 2013 ήταν Πρόεδρος στον Επιμελητηριακό Όμιλο Ανάπτυξης Ελληνικών Νησιών, στον οποίο διετέλεσε και Β’ Αντιπρόεδρος από το 2001 μέχρι το 2009 και από το 2004 μέχρι το 2007 διετέλεσε Αντιπρόεδρος στο ΚΕΤΑ του Β. Αιγαίου.
Από το 1986 μέχρι το 1994 ήταν Κοινοτικός Σύμβουλος της Κοινότητας Κουμεΐκων και Μέλος της Διοικούσας Επιτροπής της ΤΕΔΚ της Σάμου, την οποία και εκπροσώπησε, από το 1989 μέχρι το 1993, ως Σύμβουλος στο Νομαρχιακό Συμβούλιο της Σάμου, ενώ από το 1993 μέχρι το 2001 ήταν Μέλος της Επιτροπής Παρακολούθησης του ΠΕΠ Β. Αιγαίου.
Από το 1995 μέχρι το 1998 ήταν Πρόεδρος στην Κοινότητα Κουμεΐκων και με την ιδιότητα αυτή, από το 1995 μέχρι το 1998 ήταν Πρόεδρος του Συμβουλίου Περιοχής Μαραθοκάμπου.
Από το 2003 μέχρι το 2006 ήταν αιρετός Νομαρχιακός Σύμβουλος της Νομαρχιακής Αυτοδιοίκησης της Σάμου, Πρόεδρος της Νομαρχιακής Επιχείρησης Ανάπτυξης Σάμου και από το 2004 μέχρι το 2005 Πρόεδρος του Οργανισμού Τουρισμού της Νομαρχιακής Αυτοδιοίκησης Σάμου.
Από το 2007 μέχρι το 2011 ήταν Δημοτικός Σύμβουλος στο Δήμο Μαραθοκάμπου.
Από το 2011 μέχρι το 2014 ήταν Αντιπεριφερειάρχης Σάμου.
Από το 2014 μέχρι το 2018 ήταν Περιφερειακός Σύμβουλος Β. Αιγαίου.
Από 01/01/2024 εκλεγμένος Δήμαρχος Δυτικής Σάμου.